第三阶段：现代科学气功的起步和发展。 1978年12月举行的党的十一届三中全会后，春光降临，气功复生。在此之前北京的郭林就开始了“治癌气功”的传播，上海顾涵森等开始了气功外气的科研，北京、上海为气功发展的第二次高潮起了带头作用。1978年10月25日被称为气功队伍中“第一名指挥员”的卫生部中医局局长吕炳奎给中央领导写了关于发展气功工作的报告。经过准备酝酿，1979年7月14日和19日他又两次向中央领导进行了气功汇报，得到中央领导的肯定和支持。经过汇报会的传达，经过宣传酝酿和准备，1981年9月9日，医学界的中华全国气功科研会在保定成立，由此拉开了科学气功全面发展的序幕，经过近五年的发展，1986年4月综合性的中国气功科学研究会在北京成立，张震寰将军任理事长，又一位气功指挥员站了出来，进一步推动了科学气功的全面发展，气功史是气功界人和事的反映，在第三阶段中，练功人发展到6000万！在党和政府的领导下，有三种人和事比较突出：一是气功前线的指挥员，如中医局吕炳奎局长、中国气功会的张震寰理事长、黄静波理事长、九部委人体科学领导小组组长、体育气功界的领导者伍绍祖主任以及国际医学气功会的高鹤亭理事长等等，他们带领着省、地、市、县各级的领导者掌握着气功的发展方向，推动着气功组织的建立和健康发展。二是气功科研的带头人、德高望重的科学泰斗钱学森同志，他指引着气功科研的正确方向和进程。冯理达、谢焕章、陆祖荫、胡海昌、林中鹏等科技专家又具体指导着各大专院校、各科研院所的气功科研工作，进行诸多层次和诸多方面气功科研。三是以严新、庞鹤鸣等为首的气功师队伍。全国功法约七百种，各功法气功师数以万计。十几年来，发挥作用比较突出的气功师和功法有三十种左右。如郭林新气功、智能功、严新气功、导引养生功、真气运行法、养气功、武当功、少林功等等。群星灿烂，推动着6000万人的练功大潮，使气功成为当今中国众多百姓的生活内容之一，在广大城乡的全民健身活动中，形成一道道崭新而壮观的风景线。
　　气功第二次高潮的先驱郭林女士。郭林原名林冠明， 1909年生，广东中山市人。早年毕业于广东省立女子师范艺术科，历任香港同德书院、华南院、上海女子艺术学院院长，北京画院专业画家。她晚年从事气功事业取父母两姓而更名“郭林”，为“郭林新气功”的创编人。郭林幼小时就学习华佗五禽戏，对导引行气研究有素。1949年身患癌症，多次动手术不能根治。1959年又发现癌转移，开始用气功治癌，对传统功法进行改革，变静功为动静相间，呼吸采用前人较少用的风呼吸法，取得冶癌效果。在十年动乱的日子里，气功横遭批判，许多知名气功家受到迫害。就在如此背景下，郭林毅然在1970年开始到北京东单公园传授“郭林新气功”，因疗效显著，学功的人越来越多。但在“左”风盛行的当时，她练气功曾被扣上种种罪名，被赶出东单公园，但她不畏强暴，又带着功友转移到龙潭湖公园练功。经七年努力，总结了近1000例成功病例，1977年写了十万字的报告上交卫生部。为1979年向中央领导的汇报提供了重要资料，海政文化部副部长高义彬练郭林功治癌就是汇报典型之一。同时，由于疗效显著，许多报刊如《人民日报》《北京日报》《光明日报》《中国妇女》《体育报》《自然杂志》《科学园地》等均予以报道，中央电视台还为她拍摄了〈神功之谜》的记录片。著名女作家柯岩在1982年第7期〈北京文学》上发表了《癌症不等与死亡》的长篇报告文学，介绍了郭林新气功抗癌的奇迹，震动全国，北京出现了气功热潮。郭林所著《新气功疗法初级功》、《新气功疗法中级功》等书先后出版。郭林本人先后被20多个省市科协或气功组织以及邮电学院、首都机场、北京第六医院、北京师范大学、北京大学、青岛医学院附属医院、辽宁空军疗养院聘请去讲学教功。郭林新气功在中国大地上生根、发芽、开花、结果了，许多癌症患者用郭林新气功获得新生。郭林的名字由中国而传向世界，美国、加拿大、日本、印尼等国家的许许多多癌症患者，不远万里来访郭林。美国的安德生、汤姆生两位博士，日本的汉医研究所所长都曾撰文肯定和宣传郭林新气功。1986年日本成立了“新气功研究会”并专门邀请郭林的弟子前去传经。郭林的学生黄松笑女士还在美国四大医疗中心之一的M·D·N的讲坛上主讲郭林新气功的功法。郭林女士曾数次谢绝侨居美国的女儿之邀，坚辞不去美国享受安逸而富足的物质生活。她说：“在祖国生活条件虽苦些，但我热爱我的祖国、热爱气功事业。我能为祖国人民找到有效的健康之路，做出一点贡献，感到是自己一生中最大的欣慰！1984年底，郭林所从事的事业得到有关领导的肯定与支持，因过度兴奋和激动，突患脑溢血病逝。终年75岁。
　　1978年3月10日上海首次向全球宣布气功师外气有物质性。1978年3月10日上海中国科学院原子核研究所顾涵森研究员与上海中医学院气功医师林厚省合作，利用科学的仪器测试出运气疗法中的“外气”之一是受低频涨落调制的红外辐射，证实了气功者发射了带有信息的红外电磁波。这是第一次向全球宣布气功师所发“外气”具有物质性的新闻，稍后、北京陈祖范和气功师赵光用不同仪器作了与顾、林同一类的试验，得到了定性相似的结果。1979年春，区德土在中国科学院力学研究所组织的联合测试证明：气功师赵伟的外“气”能引起周围空气作特定模式的宏观运动，那么，气只能是物质的。为了进一步探测赵伟的外气效应，顾涵林还做了静电场实验，证实气功师“外气”气团整体是电中性的，气是客观的存在。外气的客观存在，为现代气功科研奠定了坚实的基础。